Caracterización de Monkeypox virus en Colombia

Abstract

Introducción: El virus de la viruela del mono (MPXV) está compuesto por un genoma de ADN bicatenario de aproximadamente 197.209 pb. La clasificación actual divide MPXV en dos clados: clado de África Central o de la Cuenca del Congo (clado 1) y clado de África Occidental (clado 2 y clado 3). Objetivo: Caracterizar el Monkeypox virus mediante análisis completo del genoma y filogenético a partir de casos detectados en Colombia. Materiales y métodos: Se obtuvieron muestras de lesiones de pacientes con diagnóstico de Monkeypox virus en El ADN total se purificó, posteriormente se realizó verificación de CT mediante PCR en tiempo real y secuenciación de amplicones con estuche y en la plataforma Oxford Nanopore. Resultados: Las lecturas de las secuencias se alinearon con el genoma de referencia del virus Monkeypox utilizando minimap2 v.2.24 y la inferencia filogenética fue realizada mediante máxima verosimilitud. Conclusión: El análisis filogenético de las secuencias genómicas de MPXV fueron estrechamente relacionadas con el clado de África Occidental reportados a nivel mundial en durante el brote de 2022.